The GENE/GIST code package is developed for the investigation of plasma microturbulence, suitable for both stellarator and tokamak configurations. The geometry module is able to process typical equilibrium files and create the interface for the gyrokinetic solver. The analytical description of the method for constructing the geometric elements is documented, together with several numerical evaluation tests. As a concrete application of this product, a cross-machine comparison of the anomalous ion heat diffusivity is presented.

1.
T. -H.
Watanabe
,
H.
Sugama
, and
S.
Ferrando-Margalet
,
Phys. Rev. Lett.
100
,
195002
(
2008
).
2.
H.
Sugama
,
T. -H.
Watanabe
, and
S.
Ferrando-Margalet
,
J. Plasma Fusion Res.
3
,
041
(
2008
).
3.
O.
Motojima
,
N.
Ohyabu
,
A.
Komori
,
O.
Kaneko
,
H.
Yamada
,
K.
Kawahata
,
Y.
Nakamura
,
K.
Ida
,
T.
Akiyama
,
N.
Ashikawa
,
W. A.
Cooper
,
A.
Ejiri
,
M.
Emoto
,
N.
Ezumi
,
H.
Funaba
,
A.
Fukuyama
,
P.
Goncharov
,
M.
Goto
,
H.
Idei
,
K.
Ikeda
,
S.
Inagaki
,
M.
Isobe
,
S.
Kado
,
H.
Kawazome
,
K.
Khlopenkov
,
T.
Kobuchi
,
K.
Kondo
,
A.
Kostrioukov
,
S.
Kubo
,
R.
Kumazawa
,
Y.
Liang
,
J. F.
Lyon
,
A.
Mase
,
S.
Masuzaki
,
T.
Minami
,
J.
Miyazawa
,
T.
Morisaki
,
S.
Morita
,
S.
Murakami
,
S.
Muto
,
T.
Mutoh
,
K.
Nagaoka
,
Y.
Nagayama
,
N.
Nakajima
,
K.
Nakamura
,
H.
Nakanishi
,
K.
Narihara
,
Y.
Narushima
,
K.
Nishimura
,
N.
Nishino
,
N.
Noda
,
T.
Notake
,
H.
Nozato
,
S.
Ohdachi
,
Y.
Oka
,
H.
Okada
,
S.
Okamura
,
M.
Osakabe
,
T.
Ozaki
,
B. J.
Peterson
,
A.
Sagara
,
T.
Saida
,
K.
Saito
,
S.
Sakakibara
,
M.
Sakamoto
,
R.
Sakamoto
,
M.
Sasao
,
K.
Sato
,
M.
Sato
,
T.
Seki
,
T.
Shimozuma
,
M.
Shoji
,
H.
Suzuki
,
Y.
Takeiri
,
N.
Takeuchi
,
N.
Tamura
,
K.
Tanaka
,
M. Y.
Tanaka
,
Y.
Teramichi
,
K.
Toi
,
T.
Tokuzawa
,
Y.
Tomota
,
Y.
Torii
,
K.
Tsumori
,
K. Y.
Watanabe
,
T.
Watari
,
Y.
Xu
,
I.
Yamada
,
S.
Yamamoto
,
T.
Yamamoto
,
M.
Yokoyama
,
S.
Yoshimura
,
Y.
Yoshimura
,
M.
Yoshinuma
,
N.
Asakura
,
T.
Fujita
,
T.
Fukuda
,
T.
Hatae
,
S.
Higashijima
,
A.
Isayama
,
Y.
Kamada
,
H.
Kubo
,
Y.
Kusama
,
Y.
Miura
,
T.
Nakano
,
H.
Ninomiya
,
T.
Oikawa
,
N.
Oyama
,
Y.
Sakamoto
,
K.
Shinohara
,
T.
Suzuki
,
H.
Takenaga
,
K.
Ushigusa
,
T.
Hino
,
M.
Ichimura
,
Y.
Takase
,
F.
Sano
,
H.
Zushi
,
T.
Satow
,
S.
Imagawa
,
T.
Mito
,
I.
Ohtake
,
T.
Uda
,
K.
Itoh
,
K.
Ohkubo
,
S.
Sudo
,
K.
Yamazaki
,
K.
Matsuoka
,
Y.
Hamada
, and
M.
Fujiwara
,
Nucl. Fusion
43
,
1674
(
2003
).
4.
G.
Grieger
,
C.
Beidler
,
E.
Harmeyer
,
J.
Junker
,
J.
Kisslinger
,
W.
Lotz
,
P.
Merkel
,
A.
Montvai
,
J.
Nührenberg
,
F.
Rau
,
A.
Schlüter
,
H.
Wobig
, and
R.
Zille
,
Plasma Physics and Controlled Nuclear Fusion Research, Proceedings of the 12th International Conference
,
Nice
,
1988
(
IAEA
,
Vienna
,
1999
), Vol.
2
, p.
369
.
5.
P.
Xanthopoulos
,
F.
Merz
,
T.
Görler
, and
F.
Jenko
,
Phys. Rev. Lett.
99
,
035002
(
2007
).
6.
F.
Jenko
,
W.
Dorland
,
M.
Kotschenreuther
, and
B. N.
Rogers
,
Phys. Plasmas
7
,
1904
(
2000
).
7.
T.
Dannert
and
F.
Jenko
,
Phys. Plasmas
12
,
072309
(
2005
).
8.
F.
Merz
, Ph.D. thesis,
University of Münster
,
2008
.
9.
S. P.
Hirshman
,
W. I.
van Rij
, and
P.
Merkel
,
Comput. Phys. Commun.
43
,
143
(
1986
).
10.
A. H.
Boozer
,
Phys. Fluids
23
,
2283
(
1980
).
11.
D.
Told
,
F.
Jenko
,
P.
Xanthopoulos
,
L. D.
Horton
,
E.
Wolfrum
, and
ASDEX Upgrade Team
,
Phys. Plasmas
15
,
102306
(
2008
).
12.
W. A.
Cooper
,
Plasma Phys. Controlled Fusion
34
,
1011
(
1992
).
13.
A.
Reiman
,
L.
Ku
,
D.
Monticello
,
S.
Hirschman
,
S.
Hudson
,
C.
Kessel
,
E.
Lazarus
,
D.
Mikkelsen
,
M.
Zarnstorff
,
L. A.
Berry
,
A.
Boozer
,
A.
Brooks
,
W. A.
Cooper
,
M.
Drevlak
,
E.
Fredrickson
,
G.
Fu
,
R.
Goldston
,
R.
Hatcher
,
M.
Isaev
,
C.
Jun
,
S.
Knowlton
,
J.
Lewandowski
,
Z.
Lin
,
J. F.
Lyon
,
P.
Merkel
,
M.
Mikhailov
,
W.
Miner
,
H.
Mynick
,
G.
Neilson
,
B. E.
Nelson
,
C.
Nuehrenberg
,
N.
Pomphrey
,
M.
Redi
,
W.
Reiersen
,
P.
Rutherford
,
R.
Sanchez
,
J.
Schmidt
,
D.
Spong
,
D.
Strickler
,
A.
Subbotin
,
P.
Valanju
, and
R.
White
,
Phys. Plasmas
8
,
2083
(
2001
).
14.
J. L.
Luxon
,
R.
Anderson
,
F.
Batty
,
C. B.
Bramson
,
N. H.
Brooks
,
B.
Brown
,
B.
Burley
,
K. H.
Burrell
,
R.
Callis
,
G.
Campbell
,
T. N.
Carlstrom
,
A. P.
Colleraine
,
J.
Cummings
,
L.
Davis
,
J. C.
DeBoo
,
S.
Ejima
,
R.
Evanko
,
H.
Fukumoto
,
R.
Gallix
,
J.
Gilleland
,
T.
Glad
,
P.
Gohil
,
A.
Gootgeld
,
R. J.
Groebner
,
S.
Hanai
,
J.
Haskovec
,
E.
Heckman
,
M.
Heilberger
,
F. J.
Helton
,
N.
Hosogane
,
C.-L.
Hsieh
,
G. L.
Jackson
,
G.
Jahns
,
G.
Janeschitz
,
E.
Johnson
,
A. G.
Kellman
,
J. S.
Kim
,
J.
Kohli
,
A.
Langhorn
,
L. L.
Lao
,
P.
Leek
,
S.
Lightner
,
J.
Lohr
,
M. A.
Mahdavi
,
M.
Mayberry
,
B.
McHarg
,
T.
McKelvey
,
R.
Miller
,
C. P.
Moeller
,
D.
Moore
,
A.
Nerem
,
P.
Noll
,
T.
Okhawa
,
N.
Ohyabu
,
T. H.
Osborne
,
D. O.
Overskei
,
P. I.
Petersen
,
T. W.
Petrie
,
J.
Phillips
,
R.
Prater
,
J.
Rawls
,
E. E.
Reis
,
D.
Remsen
,
P.
Riedy
,
P.
Rock
,
K.
Schaubel
,
D. P.
Schissel
,
J. T.
Scoville
,
R.
Seraydarian
,
M.
Shimada
,
T.
Shoji
,
B.
Sleaford
,
J. P.
Smith
, Jr.
,
T.
Smith
,
R. T.
Snider
,
R. D.
Stambaugh
,
R.
Stav
,
H.
St. John
,
R. E.
Stockdale
,
E. J.
Strait
,
T.
Stree
,
T. S.
Taylor
,
J.
Tooker
,
M.
Tupper
,
S. K.
Wong
, and
S.
Yamakuchi
,
Plasma Physics and Controlled Nuclear Fusion Research, 1986
(
IAEA
,
Vienna
,
1987
), Vol.
I
, p.
159
.
15.
D. V.
Anderson
,
W. A.
Cooper
,
R.
Gruber
,
S.
Merazzi
, and
U.
Schwenn
,
Int. J. High Perform. Comput. Appl.
4
,
34
(
1990
).
16.
M. A.
Beer
,
S. C.
Cowley
, and
G. W.
Hammett
,
Phys. Plasmas
2
,
2687
(
1995
).
17.
W. D.
D’Haeseleer
,
W. N. G.
Hitchon
,
J. D.
Callen
, and
J. L.
Shohet
,
Flux Coordinates and Magnetic Field Structure
(
Springer
,
Berlin
,
1991
).
18.
P.
Xanthopoulos
and
F.
Jenko
,
Phys. Plasmas
13
,
092301
(
2006
).
19.
S. R.
Hudson
,
Phys. Plasmas
13
,
042511
(
2006
).
20.
J. L.
Johnson
and
J. M.
Greene
,
Plasma Phys.
9
,
611
(
1967
).
You do not currently have access to this content.