We propose a new deformable free energy method for generating a free-energy coarse-graining potential for C60. Potentials generated from this approach exhibit a strong temperature dependence and produce excellent agreement with benchmark fully atomistic molecular dynamics simulations. Parameter sets for analytical fits to this potential are provided at four different temperatures.
REFERENCES
1.
H.
Kroto
, J.
Heath
, S.
O’Brien
, R.
Curl
, and R.
Smalley
, Nature
318
, 162
(1985
).2.
D. F.
Emerich
and C. G.
Thanos
, Biomol. Eng.
23
, 171
(2006
).3.
W. G.
Noid
, J.-W.
Chu
, G. S.
Ayton
, V.
Krishna
, S.
Izvekov
, G. A.
Voth
, A.
Das
, and H. C.
Andersen
, J. Chem. Phys.
128
, 244114
(2008
).4.
A. P.
Lyubartsev
and A.
Laaksonen
, Comput. Phys. Commun.
121-122
, 57
(1999
).5.
D.
Reith
, M.
Pütz
, and F.
Müller-Plathe
, J. Comput. Chem.
24
, 1624
(2003
).6.
M. S.
Shell
, J. Chem. Phys.
129
, 144108
(2008
).7.
J.
Wong-Ekkabut
, S.
Baoukina
, W.
Triampo
, I.-M.
Tang
, D. P.
Tieleman
, and L.
Monticelli
, Nat. Nanotechnol.
3
, 363
(2008
).8.
S. J.
Marrink
, H. J.
Risselada
, S.
Yefimov
, D. P.
Tieleman
, and A. H. D.
Vries
, J. Phys. Chem. B
111
, 7812
(2007
).9.
L.
Monticelli
, S. K.
Kandasamy
, X.
Periole
, R. G.
Larson
, D. P.
Tieleman
, and S. J.
Marrink
, J. Chem. Theory Comput.
4
, 819
(2008
).10.
E.
Brini
, E. A.
Algaer
, P.
Ganguly
, C.
Li
, F.
Rodríguez-Ropero
, and N. F. A.
van der Vegt
, Soft Matter
9
, 2108
(2013
).11.
H. I.
Ingólfsson
, C. A.
Lopez
, J. J.
Uusitalo
, D. H.
de Jong
, S. M.
Gopal
, X.
Periole
, and S. J.
Marrink
, Wiley Interdiscip. Rev.: Comput. Mol. Sci.
4
, 225
(2014
).12.
W. G.
Noid
, J. Chem. Phys.
139
, 090901
(2013
).13.
L. A.
Girifalco
, J. Phys. Chem.
96
, 858
(1992
).14.
L. A.
Girifalco
, Phys. Rev. B
52
, 9910
(1995
).15.
M. M. G.
Alemany
, C.
Rey
, O.
Dieguez
, and L. J.
Gallego
, J. Chem. Phys.
112
, 10711
(2000
).16.
S.
Tamaki
, N.
Ide
, I.
Okada
, and K.
Kojima
, Jpn. J. Appl. Phys., Part 1
37
, 2608
(1998
).17.
M. C.
Abramo
, C.
Caccamo
, D.
Costa
, G.
Pellicane
, and R.
Ruberto
, Phys. Rev. E
69
, 031112
(2004
).18.
J.
Jones
, Proc. R. Soc. A
106
, 463
(1924
).19.
W.
Jorgensen
, J. Am. Chem. Soc.
118
, 11225
(1996
).20.
S.
Pronk
, S.
Páll
, R.
Schulz
, P.
Larsson
, P.
Bjelkmar
, R.
Apostolov
, M. R.
Shirts
, J. C.
Smith
, P. M.
Kasson
, D.
van der Spoel
, B.
Hess
, and E.
Lindahl
, Bioinformatics
29
, 845
(2013
).21.
P.
Hünenberger
, Adv. Comput. Simul.
173
, 105
(2005
).© 2015 AIP Publishing LLC.
2015
AIP Publishing LLC
You do not currently have access to this content.
