Actin, a primary component of the cell cytoskeleton can have multiple isoforms, each of which can have specific properties uniquely suited for their purpose. These monomers are then bound together to form polymeric filaments utilizing adenosine triphosphate hydrolysis as a source of energy. Proteins, such as Arp2/3, VASP, formin, profilin, and cofilin, serve important roles in the polymerization process. These filaments can further be linked to form stress fibers by proteins called actin-binding proteins, such as α-actinin, myosin, fascin, filamin, zyxin, and epsin. These stress fibers are responsible for mechanotransduction, maintaining cell shape, cell motility, and intracellular cargo transport. Cancer metastasis, specifically epithelial mesenchymal transition (EMT), which is one of the key steps of the process, is accompanied by the formation of thick stress fibers through the Rho-associated protein kinase, MAPK/ERK, and Wnt pathways. Recently, with the advent of “field cancerization,” pre-malignant cells have also been demonstrated to possess stress fibers and related cytoskeletal features. Analytical methods ranging from western blot and RNA-sequencing to cryo-EM and fluorescent imaging have been employed to understand the structure and dynamics of actin and related proteins including polymerization/depolymerization. More recent methods involve quantifying properties of the actin cytoskeleton from fluorescent images and utilizing them to study biological processes, such as EMT. These image analysis approaches exploit the fact that filaments have a unique structure (curvilinear) compared to the noise or other artifacts to separate them. Line segments are extracted from these filament images that have assigned lengths and orientations. Coupling such methods with statistical analysis has resulted in development of a new reporter for EMT in lung cancer cells as well as their drug responses.

1.
E. J.
Cuenca-Zamora
,
F.
Ferrer-Marín
,
J.
Rivera
, and
R.
Teruel-Montoya
,
Int. J. Mol. Sci.
20
,
3484
(
2019
).
2.
A. K.
Coleman
,
H. C.
Joca
,
G.
Shi
,
W. J.
Lederer
, and
C. W.
Ward
,
J. Gen. Physiol.
153
,
e202012743
(
2021
).
3.
A.
Kumar
and
N.
Jagannathan
,
Int. J. Orofacial Biol.
2
,
6
(
2018
).
4.
D.
Guo
,
Q.
Xu
,
S.
Pabla
,
J.
Koomen
,
P.
Biddinger
,
A.
Sharma
,
S.
Pabla
,
R.
Pacholczyk
,
C. C.
Chang
,
K.
Friedrich
,
K.
Mohammed
,
R. C.
Smallridge
,
J. A.
Copland
,
J. X.
She
, and
P. M.
Weinberger
,
Int. J. Mol. Sci.
19
,
577
(
2018
).
5.
F.
Danielsson
,
M. K.
Peterson
,
H. C.
Araújo
,
F.
Lautenschläger
, and
A. K. B.
Gad
,
Cells
7
,
147
(
2018
).
6.
P. W.
Gunning
,
U.
Ghoshdastider
,
S.
Whitaker
,
D.
Popp
, and
R. C.
Robinson
,
J. Cell Sci.
128
,
2009
(
2015
).
7.
R. C.
Hightower
and
R. B.
Meagher
,
Genetics
114
,
315
(
1986
).
8.
J.
Vandekerckhove
and
K.
Weber
,
J. Mol. Biol.
126
,
783
(
1978
).
9.
I. M.
Herman
,
Curr. Opin. Cell Biol.
5
,
48
(
1993
).
10.
V. B.
Dugina
,
G. S.
Shagieva
, and
P. B.
Kopnin
,
Biochemistry
84
,
583
(
2019
).
11.
J. I.
Garrels
and
W.
Gibson
,
Cell
9
,
793
(
1976
).
12.
P. A.
Rubenstein
,
BioEssays
12
,
309
(
1990
).
13.
A.
Chen
,
P. D.
Arora
,
C. A.
McCulloch
, and
A.
Wilde
,
Nat. Commun.
8
,
1530
(
2017
).
14.
P.
Cervero
,
C.
Wiesner
,
A.
Bouissou
,
R.
Poincloux
, and
S.
Linder
,
Nat. Commun.
9
,
515
(
2018
).
15.
X.
Patrinostro
,
A. R.
O'Rourke
,
C. M.
Chamberlain
,
B. S.
Moriarity
,
B. J.
Perrin
, and
J. M.
Ervasti
,
Mol. Biol. Cell
28
,
771
(
2017
).
16.
V.
Dugina
,
I.
Zwaenepoel
,
G.
Gabbiani
,
S.
Clément
, and
C.
Chaponnier
,
J. Cell Sci.
122
,
2980
(
2009
).
17.
C. C.
Westhoff
,
K.
Schoner
,
S.
Hartmann
,
A. M.
Sesterhenn
, and
R.
Moll
,
Virchows Arch.
470
,
285
(
2017
).
18.
M. A.
Hill
and
P.
Gunning
,
J. Cell Biol.
122
,
825
(
1993
).
19.
H.
Watanabe
,
E. H.
Kislauskis
,
C. A.
Mackay
,
A.
Mason-Savas
, and
S. C.
Marks
,
J. Cell Sci.
111
,
1287
(
1998
).
20.
G. J.
Bassell
,
H.
Zhang
,
A. L.
Byrd
,
A. M.
Femino
,
R. H.
Singer
,
K. L.
Taneja
,
L. M.
Lifshitz
,
I. M.
Herman
, and
K. S.
Kosik
,
J. Neurosci.
18
,
251
(
1998
).
21.
K. M.
McHugh
,
K.
Crawford
, and
J. L.
Lessard
,
Dev. Biol.
148
,
442
(
1991
).
22.
G.
Gabbiani
,
O.
Kocher
,
J.
Vandekerckhove
,
B.
Gent
, and
K.
Weber
,
J. Clin. Invest.
73
,
148
(
1984
).
23.
J.
Wang
,
R.
Zohar
, and
C. A.
McCulloch
,
Exp. Cell Res.
312
,
205
(
2006
).
24.
C.
Chaponnier
,
M.
Goethals
,
P. A.
Janmey
,
F.
Gabbiani
,
G.
Gabbiani
, and
J.
Vandekerckhove
,
J. Cell Biol.
130
,
887
(
1995
).
25.
H.
Matsson
,
J.
Eason
,
C. S.
Bookwalter
,
J.
Klar
,
P.
Gustavsson
,
J.
Sunnegårdh
,
H.
Enell
,
A.
Jonzon
,
M.
Vikkula
,
I.
Gutierrez
,
J.
Granados-Riveron
,
M.
Pope
,
F.
Bu'lock
,
J.
Cox
,
T. E.
Robinson
,
F.
Song
,
D. J.
Brook
,
S.
Marston
,
K. M.
Trybus
, and
N.
Dahl
,
Hum. Mol. Genet.
17
,
256
(
2008
).
26.
D.
Frank
,
A. Y.
Rangrez
,
C.
Friedrich
,
S.
Dittmann
,
B.
Stallmeyer
,
P.
Yadav
,
A.
Bernt
,
E.
Schulze-Bahr
,
A.
Borlepawar
,
W. H.
Zimmermann
,
S.
Peischard
,
G.
Seebohm
,
W. A.
Linke
,
H. A.
Baba
,
M.
Krüger
,
A.
Unger
,
P.
Usinger
,
N.
Frey
, and
E.
Schulze-Bahr
,
Circ.: Genomic Precis. Med.
12
,
345
(
2019
).
27.
B.
Swynghedauw
,
Physiol. Rev.
66
,
710
(
1986
).
28.
T. E.
Hewett
,
I. L.
Grupp
,
G.
Grupp
, and
J.
Robbins
,
Circ. Res.
74
,
740
(
1994
).
29.
L. D.
Bertola
,
E. B.
Ott
,
S.
Griepsma
,
F. J.
Vonk
, and
C. P.
Bagowski
,
BMC Evol. Biol.
8
,
166
(
2008
).
30.
K. J.
Brennan
and
E. C.
Hardeman
,
J. Biol. Chem.
268
,
719
(
1993
).
31.
V.
Dugina
,
G.
Shagieva
,
N.
Khromova
, and
P.
Kopnin
,
Cell Cycle
17
,
2610
(
2018
).
32.
L. A.
Schildmeyer
,
R.
Braun
,
G.
Taffet
,
M.
Debiasi
,
A. E.
Burns
,
A.
Bradley
, and
R. J.
Schwartz
,
FASEB J.
14
,
2213
(
2000
).
33.
B.
Hinz
,
V.
Dugina
,
C.
Ballestrem
,
B.
Wehrle-Haller
, and
C.
Chaponnier
,
Mol. Biol. Cell
14
,
2508
(
2003
).
34.
J.
Wang
,
J.
Fan
,
C.
Laschinger
,
P. D.
Arora
,
A.
Kapus
,
A.
Seth
, and
C. A.
McCulloch
,
J. Biol. Chem.
280
,
7273
(
2005
).
35.
J.
Wang
,
A.
Seth
, and
A. G.
Mcculloch
,
Am. J. Physiol. Heart Circ. Physiol.
279
,
H2776
(
2000
).
36.
J.
Wang
,
H.
Chen
,
A.
Seth
, and
C. A.
McCulloch
,
Am. J. Physiol. Heart Circ. Physiol.
285
,
H1871
(
2003
).
37.
B.
Kuehlmann
,
C. A.
Bonham
,
I.
Zucal
,
L.
Prantl
, and
G. C.
Gurtner
,
J. Clin. Med.
9
,
1423
(
2020
).
38.
A. v
Shinde
,
C.
Humeres
, and
N. G.
Frangogiannis
,
Biochim. Biophys. Acta Mol. Basis Dis.
1863
,
298
(
2017
).
39.
F.
Grinnell
,
J. Cell Biol.
124
,
401
(
1994
).
40.
J. V.
Jester
,
W. M.
Petroll
,
P. A.
Barry
, and
H. D.
Cavanagh
,
Invest. Ophthalmol. Visual Sci.
36
,
809
(
1995
), https://iovs.arvojournals.org/article.aspx?articleid=2161222.
41.
D. C.
Rockey
,
Q.
Du
, and
Z.
Shi
,
Am. J. Pathol.
189
,
2209
(
2019
).
42.
S.
Jimi
,
M.
Kimura
,
F.
de Francesco
,
M.
Riccio
,
S.
Hara
, and
H.
Ohjimi
,
Int. J. Mol. Sci.
18
,
1675
(
2017
).
43.
P. D.
Arora
,
N.
Narani
, and
C. A. G.
McCulloch
,
Am. J. Pathol.
154
,
871
(
1999
).
44.
J. J.
Tomasek
,
G.
Gabbiani
,
B.
Hinz
,
C.
Chaponnier
, and
R. A.
Brown
,
Nat. Rev. Mol. Cell Biol.
3
,
349
(
2002
).
45.
M.
Karakozova
,
M.
Kozak
,
C. C. L.
Wong
,
A. O.
Bailey
,
J. R. Y.
Iii
,
A.
Mogilner
,
H.
Zebroski
, and
A.
Kashina
,
Science
313
192
(
2006
).
46.
W.
Shawlot
,
J. M.
Deng
,
L. E.
Fohn
, and
R. R.
Behringer
,
Transgenic Res.
7
,
95
(
1998
).
47.
T. M.
Bunnell
and
J. M.
Ervasti
,
Cytoskeleton
67
,
564
(
2010
).
48.
W. A.
Hofmann
,
L.
Stojiljkovic
,
B.
Fuchsova
,
G. M.
Vargas
,
E.
Mavrommatis
,
V.
Philimonenko
,
K.
Kysela
,
J. A.
Goodrich
,
J. L.
Lessard
,
T. J.
Hope
,
P.
Hozak
, and
P.
de Lanerolle
,
Nat. Cell Biol.
6
,
1094
(
2004
).
49.
P.
Hu
,
S.
Wu
, and
N.
Hernandez
,
Genes Dev.
18
,
3010
(
2004
).
50.
J.
Yao
,
Y.
Sasaki
,
Z.
Wen
,
G. J.
Bassell
, and
J. Q.
Zheng
,
Nat. Neurosci.
9
,
1265
(
2006
).
51.
E. M.
Small
,
J. Cardiovasc. Transl. Res.
5
,
794
(
2012
).
52.
T. M.
Bunnell
,
B. J.
Burbach
,
Y.
Shimizu
, and
J. M.
Ervasti
,
Mol. Biol. Cell
22
,
4047
(
2011
).
53.
C.
Brockmann
,
J.
Huarte
,
V.
Dugina
,
L.
Challet
,
E.
Rey
,
B.
Conne
,
A.
Swetloff
,
S.
Nef
,
C.
Chaponnier
, and
J. D.
Vassalli
,
Biol. Reprod.
85
,
1025
(
2011
).
54.
J.
Vandekerckhove
and
K.
Weber
,
Differentiation
14
,
123
(
1979
).
55.
L. M.
Hanft
,
IN.
Rybakova
,
J. R.
Patel
,
J. A.
Rafael-Fortney
, and
J. M.
Ervasti
,
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A.
103
,
5385
(
2006
).
56.
I. A.
Belyantseva
,
B. J.
Perrin
,
K. J.
Sonnemann
,
M.
Zhu
,
R.
Stepanyan
,
J.
McGee
,
G. I.
Frolenkov
,
E. J.
Walsh
,
K. H.
Friderici
,
T. B.
Friedman
, and
J. M.
Ervasti
,
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A.
106
,
9703
(
2009
).
57.
T. D.
Pollard
and
G. G.
Borisy
,
Cell
112
,
453
(
2003
).
58.
T. D.
Pollard
and
J. A.
Cooper
,
Science
326
,
1208
(
2009
).
59.
S.
Tojkander
,
G.
Gateva
, and
P.
Lappalainen
,
J. Cell Sci.
125
,
1855
(
2012
).
60.
T.
Svitkina
,
Cold Spring Harbor Perspect. Biol.
10
(
1
),
a018267
(
2018
).
61.
S.
Pellegrin
and
H.
Mellor
,
J. Cell Sci.
120
,
3491
(
2007
).
62.
T. M.
Svitkina
,
Trends Cell Biol.
30
,
556
(
2020
).
63.
S. Z.
Chou
and
T. D.
Pollard
,
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A.
116
,
4265
(
2019
).
64.
I.
Rouiller
,
X. P.
Xu
,
K. J.
Amann
,
C.
Egile
,
S.
Nickell
,
D.
Nicastro
,
R.
Li
,
T. D.
Pollard
,
N.
Volkmann
, and
D.
Hanein
,
J. Cell Biol.
180
,
887
(
2008
).
65.
J.
Liman
,
C.
Bueno
,
Y.
Eliaz
,
N. P.
Schafer
,
M. N.
Waxham
,
P. G.
Wolynes
,
H.
Levine
, and
M. S.
Cheung
,
Proc. Nat. Acad. Sci. U. S. A.
117
,
10825
(
2020
).
66.
L. M.
Machesky
,
R. D.
Mullins
,
H. N.
Higgs
,
D. A.
Kaiser
,
L.
Blanchoin
,
R. C.
May
,
M. E.
Hall
, and
T. D.
Pollard
,
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A.
96
,
3739
(
1999
).
67.
A. S.
Paul
and
T. D.
Pollard
,
Cell Motil. Cytoskeleton
66
,
606
(
2009
).
68.
S. H.
Zigmond
,
Curr. Opin. Cell Biol.
16
,
99
(
2004
).
69.
S. H.
Zigmond
,
M.
Evangelists
,
C.
Boone
,
C.
Yang
,
A. C.
Dar
,
F.
Sicheri
,
J.
Forkey
, and
M.
Pring
,
Curr. Biol.
13
,
1820
(
2003
).
70.
D. R.
Kovar
,
J.-Q.
Wu
, and
T. D.
Pollard
,
Mol. Biol. Cell
16
,
2313
(
2005
).
71.
T. D.
Pollard
,
Cold Spring Harbor Perspect. Biol.
8
,
a018226
(
2016
).
72.
T. D.
Pollard
,
Ann. Rev. Biochem.
55
,
987
(
1986
).
73.
S. R.
Gross
,
Cell Adhes. Migr.
7
,
199
(
2013
).
74.
H. L.
Sweeney
and
E. L. F.
Holzbaur
,
Cold Spring Harbor Perspect. Biol.
10
,
a021931
(
2018
).
75.
A.
Mentes
,
A.
Huehn
,
X.
Liu
,
A.
Zwolak
,
R.
Dominguez
,
H.
Shuman
,
E. M.
Ostap
, and
C. V.
Sindelar
,
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A.
115
,
1292
(
2018
).
76.
L. K.
Gunther
,
J. A.
Rohde
,
W.
Tang
,
J. A.
Cirilo
,
C. P.
Marang
,
B. D.
Scott
,
D. D.
Thomas
,
E. P.
Debold
, and
C. M.
Yengo
,
J. Biol. Chem.
295
,
17383
(
2020
).
77.
O. S.
Matusovsky
,
N.
Kodera
,
C.
Maceachen
,
T.
Ando
,
Y. S.
Cheng
, and
D. E.
Rassier
,
ACS Nano
15
,
2229
(
2021
).
78.
J.
Robert-Paganin
,
O.
Pylypenko
,
C.
Kikuti
,
H. L.
Sweeney
, and
A.
Houdusse
,
Chem. Rev.
120
,
5
(
2020
).
79.
J. M.
Ryan
and
A.
Nebenführ
,
Plant Physiol.
176
,
119
(
2018
).
80.
B.
Sjoblom
,
A.
Salmazo
, and
K.
Djinovic-Carugo
,
Cell. Mol. Life Sci.
65
,
2688
(
2008
).
81.
C. A.
Otey
and
O.
Carpen
,
Cell Motil. Cytoskeleton
58
,
104
(
2004
).
82.
A.
Blanchard
,
V.
Ohanian
, and
D.
Critchley
,
J. Muscle Res. Cell Motil.
10
,
280
(
1989
).
83.
F. M.
Pavalko
and
K.
Burridge
,
J. Cell Biol.
114
,
481
(
1991
).
84.
M.
Edlund
,
M. A.
Lotano
, and
C. A.
Otey
,
Cell Motil. Cytoskeleton
48
,
190
(
2001
).
85.
S.
Lin
,
M. D.
Taylor
,
P. K.
Singh
, and
S.
Yang
,
FEBS J.
288
,
1434
(
2021
).
86.
P. W.
Oakes
,
E.
Wagner
,
C. A.
Brand
,
D.
Probst
,
M.
Linke
,
U. S.
Schwarz
,
M.
Glotzer
, and
M. L.
Gardel
,
Nat. Commun.
8
,
15817
(
2017
).
87.
Y. X.
Wang
,
D. Y.
Wang
,
Y. C.
Guo
, and
J.
Guo
,
Eur. Rev. Med. Pharmacol. Sci.
23
,
413
(
2019
).
88.
A.
Kumar
,
M. S.
Shutova
,
K.
Tanaka
,
D. V.
Iwamoto
,
D. A.
Calderwood
,
T. M.
Svitkina
, and
M. A.
Schwartz
,
J. Cell Biol.
218
,
2481
(
2019
).
89.
A.
Donada
,
N.
Balayn
,
D.
Sliwa
,
L.
Lordier
,
V.
Ceglia
,
F.
Baschieri
,
C.
Goizet
,
R.
Favier
,
L.
Tosca
,
G.
Tachdjian
,
C. v
Denis
,
I.
Plo
,
W.
Vainchenker
,
N.
Debili
,
J. P.
Rosa
,
M.
Bryckaert
, and
H.
Raslova
,
Blood
133
,
1778
(
2019
).
90.
M.
Messa
,
R.
Fernández-Busnadiego
,
E. W.
Sun
,
H.
Chen
,
H.
Czapla
,
K.
Wrasman
,
Y.
Wu
,
G.
Ko
,
T.
Ross
,
B.
Wendland
, and
P.
de Camilli
,
Elife
3
,
e03311
(
2014
).
91.
K.
Burridge
and
C.
Guilluy
,
Exp. Cell Res.
343
,
14
(
2016
).
92.
M. S.
Bauer
,
F.
Baumann
,
C.
Daday
,
P.
Redondo
,
E.
Durner
,
M. A.
Jobst
,
L. F.
Milles
,
D.
Mercadante
,
D. A.
Pippig
,
H. E.
Gaub
,
F.
Gräter
, and
D.
Lietha
,
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A.
116
,
6766
(
2019
).
93.
K.
Katoh
,
PeerJ
5
,
e4063
(
2017
).
94.
C. E.
Turner
,
Nat. Cell Biol.
2
,
E231
(
2000
).
95.
M.
Maninová
and
T.
Vomastek
,
FEBS J.
283
,
3676
(
2016
).
96.
A.
Basu
,
M. K.
Paul
,
M.
Alioscha-Perez
,
A.
Grosberg
,
H.
Sahli
,
S. M.
Dubinett
, and
S.
Weiss
,
Commun. Biol.
5
,
407
(
2022
).
97.
D. M.
Rutkowski
and
D.
Vavylonis
,
PLoS Comput. Biol.
17
,
e1009506
(
2021
).
98.
S.
Lee
,
E.
Kassianidou
, and
S.
Kumar
,
Mol. Biol. Cell
29
,
1992
(
2018
).
99.
H. F.
Paterson
,
A. J.
Self
,
M. D.
Garrett
,
I.
Just
,
K.
Aktories
, and
A.
Hall
,
J. Cell Biol.
111
,
1001
(
1990
).
100.
M.
Fernandez-Borja
,
L.
Janssen
,
D.
Verwoerd
,
P.
Hordijk
, and
J.
Neefjes
,
J. Cell Sci.
118
,
2661
(
2005
).
101.
P.
Chardin
,
P.
Boquet
,
P.
Madaule
,
M. R.
Popoff
,
E. J.
Rubin
, and
D. M.
Gill
,
EMBO J.
8
,
1087
(
1989
).
102.
T.
Leung
,
X. Q.
Chen
,
E.
Manser
, and
L.
Lim
,
Mol. Cell Biol.
16
,
5313
(
1996
).
103.
Y.
Ward
,
S. F.
Yap
,
V.
Ravichandran
,
F.
Matsumura
,
M.
Ito
,
B.
Spinelli
, and
K.
Kelly
,
J. Cell Biol.
157
,
291
(
2002
).
104.
M.
Amano
,
M.
Ito
,
K.
Kimura
,
Y.
Fukata
,
K.
Chihara
,
T.
Nakano
,
Y.
Matsuura
, and
K.
Kaibuchi
,
J. Biol. Chem.
271
,
20246
(
1996
).
105.
K.
Katoh
,
Y.
Kano
,
M.
Amano
,
H.
Onishi
,
K.
Kaibuchi
, and
K.
Fujiwara
,
J. Cell Biol.
152
,
569
(
2001
).
106.
R. D.
Mullins
and
T. D.
Pollard
,
Curr. Biol.
9
,
405
(
1999
).
107.
C.
Higashida
 et al,
Science
303
,
2007
(
2004
).
108.
N.
Watanabe
,
P.
Madaule
,
T.
Reid
,
T.
Ishizaki
,
G.
Watanabe
,
A.
Kakizuka
,
Y.
Saito
,
K.
Nakao
,
B. M.
Jockusch
, and
S.
Narumiya
,
EMBO J.
16
,
3044
(
1997
).
109.
N.
Watanabe
,
T.
Kato
,
A.
Fujita
,
T.
Ishizaki
, and
S.
Narumiya
,
Nat. Cell Biol.
1
,
136
(
1999
).
110.
S. A.
Johnston
,
J. P.
Bramble
,
C. L.
Yeung
,
P. M.
Mendes
, and
L. M.
Machesky
,
BMC Cell Biol.
9
,
65
(
2008
).
111.
T.
Suzuki
,
H.
Mimuro
,
H.
Miki
,
T.
Takenawa
,
T.
Sasaki
,
H.
Nakanishi
,
Y.
Takai
, and
C.
Sasakawa
,
J. Exp. Med.
191
,
1905
(
2000
).
112.
J.
Colombelli
,
A.
Besser
,
H.
Kress
,
E. G.
Reynaud
,
P.
Girard
,
E.
Caussinus
,
U.
Haselmann
,
J. v
Small
,
U. S.
Schwarz
, and
E. H. K.
Stelzer
,
J. Cell Sci.
122
,
1665
(
2009
).
113.
K.
Hayakawa
,
H.
Tatsumi
, and
M.
Sokabe
,
J. Cell Sci.
121
,
496
(
2008
).
114.
M.
Prager-Khoutorsky
,
A.
Lichtenstein
,
R.
Krishnan
,
K.
Rajendran
,
A.
Mayo
,
Z.
Kam
,
B.
Geiger
, and
A. D.
Bershadsky
,
Nat. Cell Biol.
13
,
1457
(
2011
).
115.
D. E.
Discher
,
P.
Janmey
, and
Y. L.
Wang
,
Science
310
,
1139
(
2005
).
116.
A. J.
Engler
,
S.
Sen
,
H. L.
Sweeney
, and
D. E.
Discher
,
Cell
126
,
677
(
2006
).
117.
J.
Sun
,
D.
Zhang
,
Y.
Zheng
,
Q.
Zhao
,
M.
Zheng
,
Z.
Kovacevic
, and
D. R.
Richardson
,
Mol. Pharmacol.
83
,
454
(
2013
).
118.
A.
Ponti
,
M.
Machacek
,
S. L.
Gupton
,
C. M.
Waterman-Storer
, and
G.
Danuser
,
Science
305
,
1782
(
2004
).
119.
A. M.
Malek
and
S.
Izumo
,
J. Cell Sci.
109
,
713
(
1996
).
120.
D.
Szymanski
and
C. J.
Staiger
,
Plant Physiol.
176
,
106
(
2018
).
121.
R.
Kalluri
and
R. A.
Weinberg
,
J. Clin. Invest.
119
,
1420
(
2009
).
122.
S. P.
Gross
,
M.
Vershinin
, and
G. T.
Shubeita
,
Curr. Biol.
17
,
R478
(
2007
).
123.
L.
Cramer
,
Curr. Biol.
18
,
1066
(
2008
).
124.
J. G.
Joseph
and
A. P.
Liu
,
Adv. Biosyst.
4
,
1900278
(
2020
).
125.
D. J.
Caster
,
E. A.
Korte
,
M.
Tan
,
M. T.
Barati
,
S.
Tandon
,
T. M.
Creed
,
D. J.
Salant
,
J. L.
Hata
,
P. N.
Epstein
,
H.
Huang
,
D. W.
Powell
, and
K. R.
McLeish
,
Am. J. Physiol. Renal Physiol.
315
,
F595
(
2018
).
126.
R. L.
Siegel
,
K. D.
Miller
, and
A.
Jemal
,
CA Cancer J. Clin.
70
,
7
(
2020
).
127.
A.
Jemal
,
R.
Siegel
,
E.
Ward
,
Y.
Hao
,
J.
Xu
,
T.
Murray
, and
M. J.
Thun
,
CA Cancer J. Clin.
58
,
71
(
2008
).
128.
K. D.
Kochanek
,
J.
Xu
, and
E.
Arias
, NCHS Data Brief No. 395 (
2020
), https://www.cdc.gov/nchs/products/databriefs/db395.htm.
129.
R.
Salehi-Rad
,
R.
Li
,
M. K.
Paul
,
S. M.
Dubinett
, and
B.
Liu
,
Clin. Chest Med.
41
,
25
(
2020
).
130.
A.
Mukherjee
,
M.
Paul
, and
S.
Mukherjee
,
Cancers
11
,
597
(
2019
).
131.
M.
Ruwali
,
K.
Moharir
,
S.
Singh
,
P.
Aggarwal
, and
M. K.
Paul
, in
Pharmacogenetics
(
IntechOpen
,
2021
).
132.
H.
Harðardóttir
,
S.
Jónsson
,
Ö.
Gunnarsson
,
B.
Hilmarsdóttir
,
J.
Ásmundsson
,
I.
Guðmundsdóttir
,
V. Ý.
Sævarsdóttir
,
S.
Hansdóttir
,
P.
Hannesson
, and
T.
Guðbjartsson
,
Laeknabladid
108
,
17
(
2022
).
133.
D.
Hanahan
and
R. A.
Weinberg
,
Cell
144
,
646
(
2011
).
134.
P. A. J.
Muller
and
K. H.
Vousden
,
Nat. Cell Biol.
15
,
2
(
2013
).
135.
R.
Lugano
,
M.
Ramachandran
, and
A.
Dimberg
,
Cell. Mol. Life Sci.
77
,
1745
(
2020
).
136.
V.
Vasioukhin
,
C.
Bauer
,
M.
Yin
, and
E.
Fuchs
,
Cell
100
,
209
(
2000
).
137.
F.
Martin-Belmonte
and
M.
Perez-Moreno
,
Nat. Rev. Cancer
12
,
23
(
2012
).
138.
U.
Tepass
,
G.
Tanentzapf
,
R.
Ward
, and
R.
Fehon
,
Annu. Rev. Genet.
35
,
747
(
2001
).
139.
T. Y.
Na
,
L.
Schecterson
,
A. M.
Mendonsa
, and
B. M.
Gumbiner
,
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A.
117
,
5931
(
2020
).
140.
S.
Lamouille
,
J.
Xu
, and
R.
Derynck
,
Nat. Rev. Mol. Cell Biol.
15
,
178
(
2014
).
141.
J.
Roche
,
Cancers
10
,
52
(
2018
).
142.
F.
Nurwidya
,
F.
Takahashi
,
A.
Murakami
, and
K.
Takahashi
,
Cancer Res. Treat.
44
,
151
(
2012
).
143.
D.
Xiao
and
J.
He
,
J. Thorac. Dis.
14
,
154
(
2010
).
144.
M. A.
Nieto
,
Science
342
,
1234850
(
2013
).
145.
C.-Y.
Loh
,
J. Y.
Chai
,
T. F.
Tang
,
W. F.
Wong
,
G.
Sethi
,
M. K.
Shanmugam
,
P. P.
Chong
, and
C. Y.
Loo
,
Cells
8
,
1118
(
2019
).
146.
S.
Pece
and
J. S.
Gutkind
,
J. Biol. Chem.
275
,
41227
(
2000
).
147.
S.
Nakajima
,
R.
Doi
,
E.
Toyoda
,
S.
Tsuji
,
M.
Wada
,
M.
Koizumi
,
S. S.
Tulachan
,
D.
Ito
,
K.
Kami
,
T.
Mori
,
Y.
Kawaguchi
,
K.
Fujimoto
,
R.
Hosotani
, and
M.
Imamura
,
Clin. Cancer Res.
10
,
4125
(
2004
).
148.
X.
Zhang
,
G.
Liu
,
Y.
Kang
,
Z.
Dong
,
Q.
Qian
, and
X.
Ma
,
PLoS One
8
,
e57692
(
2013
).
149.
P.
Zhang
,
Y.
Sun
, and
L.
Ma
,
Cell Cycle
14
,
481
(
2015
).
150.
J.
Grzegrzolka
,
M.
Biala
,
P.
Wojtyra
,
C.
Kobierzycki
,
M.
Olbromski
,
A.
Gomulkiewicz
,
A.
Piotrowska
,
J.
Rys
,
M.
Podhorska-Okolow
, and
P.
Dziegiel
,
Anticancer Res.
35
,
3961
(
2015
), https://ar.iiarjournals.org/content/35/7/3961.long.
151.
S.
Dolati
,
F.
Kage
,
J.
Mueller
,
M.
Müsken
,
M.
Kirchner
,
G.
Dittmar
,
M.
Sixt
,
K.
Rottner
, and
M.
Falckea
,
Mol. Biol. Cell
29
,
2674
(
2018
).
152.
A.
Bertolo
,
A.
Gemperli
,
M.
Gruber
,
B.
Gantenbein
,
M.
Baur
,
T.
Potzel
, and
J.
Stoyanov
,
Stem Cells Transl. Med.
4
,
84
(
2015
).
153.
J.
Haynes
,
J.
Srivastava
,
N.
Madson
,
T.
Wittmann
, and
D. L.
Barber
,
Mol. Biol. Cell
22
,
4750
(
2011
).
154.
J.
Aseervatham
,
Biology
9
,
385
(
2020
).
155.
L. D.
Osborne
,
G. Z.
Li
,
T.
How
,
E. T.
O'Brien
,
G. C.
Blobe
,
R.
Superfine
, and
K.
Mythreye
,
Mol. Biol. Cell
25
,
3528
(
2014
).
156.
H. H.
Lin
,
H. K.
Lin
,
I. H.
Lin
,
Y. W.
Chiou
,
H. W.
Chen
,
C. Y.
Liu
,
H. I. C.
Harn
,
W. T.
Chiu
,
Y. K.
Wang
,
M. R.
Shen
, and
M. J.
Tang
,
Oncotarget
6
,
20946
(
2015
).
157.
J.
Guck
,
S.
Schinkinger
,
B.
Lincoln
,
F.
Wottawah
,
S.
Ebert
,
M.
Romeyke
,
D.
Lenz
,
E. M. R.
Ananthakrishnan
,
D.
Mitchell
,
J.
Kas
,
S.
Ulvick
, and
C.
Bilby
,
Biophys. J.
88
,
3689
(
2005
).
158.
A.
Fritsch
,
M.
Höckel
,
T.
Kiessling
,
K. D.
Nnetu
,
F.
Wetzel
,
M.
Zink
, and
J. A.
Käs
,
Nat. Phys.
6
,
730
(
2010
).
159.
S.
Tavares
,
A. F.
Vieira
,
A. V.
Taubenberger
,
M.
Araújo
,
N. P.
Martins
,
C.
Brás-Pereira
,
A.
Polónia
,
M.
Herbig
,
C.
Barreto
,
O.
Otto
,
J.
Cardoso
,
J. B.
Pereira-Leal
,
J.
Guck
,
J.
Paredes
, and
F.
Janody
,
Nat. Commun.
8
,
15237
(
2017
).
160.
E.
Gladilin
,
S.
Ohse
,
M.
Boerries
,
H.
Busch
,
C.
Xu
,
M.
Schneider
,
M.
Meister
, and
R.
Eils
,
Sci. Rep.
9
(
1
),
7667
(
2019
).
161.
A. S.
Chikina
,
S. N.
Rubtsova
,
M. E.
Lomakina
,
D. M.
Potashnikova
,
I. A.
Vorobjev
, and
A. Y.
Alexandrova
,
Biol. Cell
111
,
245
(
2019
).
162.
S.
Sharma
and
R.
Bhonde
,
J. Cell Physiol.
230
,
657
(
2015
).
163.
O.
Ndozangue-Touriguine
,
J.
Hamelin
, and
J.
Bréard
,
Biochem. Pharmacol.
76
,
11
(
2008
).
164.
C. M.
Denais
,
R. M.
Gilbert
,
P.
Isermann
,
A. I.
McGregor
,
M.
te Lindert
,
B.
Weigelin
,
P. M.
Davidson
,
P.
Friedl
,
K.
Wolf
, and
J.
Lammerding
,
Science
352
,
353
(
2016
).
165.
E. M.
Hatch
and
M. W.
Hetzer
,
J. Cell Biol.
215
,
27
(
2016
).
166.
M. E.
Kidd
,
D. K.
Shumaker
, and
K. M.
Ridge
,
Am. J. Respir. Cell Mol. Biol.
50
(
1
),
1
(
2014
).
167.
K.
Strouhalova
,
M.
Přechová
,
A.
Gandalovičová
,
J.
Brábek
,
M.
Gregor
, and
D.
Rosel
,
Cancers
12
(
1
),
184
(
2020
).
168.
Z.
Ostrowska-Podhorodecka
and
C. A.
McCulloch
,
Wound Repair Regen.
29
,
602
(
2021
).
169.
H.
Wu
,
Y.
Shen
,
S.
Sivagurunathan
,
M. S.
Weber
,
S. A.
Adam
,
J. H.
Shin
,
J. J.
Fredberg
,
O.
Medalia
,
R.
Goldman
,
D. A.
Weitz
, and
J.
Lippincott-Schwartz
,
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A.
119
,
e2115217119
(
2022
).
170.
C. M.
Fife
,
J. A.
McCarroll
, and
M.
Kavallaris
,
Br. J. Pharmacol.
171
,
5507
(
2014
).
171.
L. G.
Karacosta
,
B.
Anchang
,
N.
Ignatiadis
,
S. C.
Kimmey
,
J. A.
Benson
,
J. B.
Shrager
,
R.
Tibshirani
,
S. C.
Bendall
, and
S. K.
Plevritis
,
Nat. Commun.
10
(
1
),
5587
(
2019
).
172.
T.
Zhang
,
L.
Liu
,
W.
Lai
,
Y.
Zeng
,
H.
Xu
,
Q.
Lan
,
P.
Su
, and
Z.
Chu
,
Oncol. Rep.
41
,
2790
(
2019
).
173.
C. T. G.
Appleton
,
S. E.
Usmani
,
J. S.
Mort
, and
F.
Beier
,
Lab. Invest.
90
,
20
(
2010
).
174.
L.
Xie
,
B. K.
Law
,
A. M.
Chytil
,
K. A.
Brown
,
M. E.
Aakre
, and
H. L.
Moses
,
Neoplasia
6
,
603
(
2004
).
175.
M.
Esposito
,
C.
Fang
,
K. C.
Cook
,
N.
Park
,
Y.
Wei
,
C.
Spadazzi
,
D.
Bracha
,
R. T.
Gunaratna
,
G.
Laevsky
,
C. J.
DeCoste
,
H.
Slabodkin
,
C. P.
Brangwynne
,
I. M.
Cristea
, and
Y.
Kang
,
Nat. Cell Biol.
23
,
257
(
2021
).
176.
H.
Yamanaka
,
T.
Moriguchi
,
N.
Masuyama
,
M.
Kusakabe
,
H.
Hanafusa
,
R.
Takada
,
S.
Takada
, and
E.
Nishida
,
EMBO Rep.
3
,
69
(
2002
).
177.
D.
Ribatti
,
R.
Tamma
, and
T.
Annese
,
Transl. Oncol.
13
,
100773
(
2020
).
178.
P. C.
Pagano
,
L. M.
Tran
,
N.
Bendris
,
S.
O'Byrne
,
H. T.
Tse
,
S.
Sharma
,
J. W.
Hoech
,
S. J.
Park
,
E. L.
Liclican
,
Z.
Jing
,
R.
Li
,
K.
Krysan
,
M. K.
Paul
,
Y.
Fontebasso
,
J. E.
Larsen
,
S.
Hakimi
,
A.
Seki
,
M. C.
Fishbein
,
J. K.
Gimzewski
,
D.
di Carlo
,
J. D.
Minna
,
T. C.
Walser
, and
S. M.
Dubinett
,
Cancer Prev. Res.
10
,
514
(
2017
).
179.
E.
Dotan
,
S. J.
Cohen
,
K. R.
Alpaugh
, and
N. J.
Meropol
,
Oncologist
14
,
1070
(
2009
).
180.
F.
Tanaka
,
K.
Yoneda
,
N.
Kondo
,
M.
Hashimoto
,
T.
Takuwa
,
S.
Matsumoto
,
Y.
Okumura
,
S.
Rahman
,
N.
Tsubota
,
T.
Tsujimura
,
K.
Kuribayashi
,
K.
Fukuoka
,
T.
Nakano
, and
S.
Hasegawa
,
Clin. Cancer Res.
15
,
6980
(
2009
).
181.
Y.
Okumura
,
F.
Tanaka
,
K.
Yoneda
,
M.
Hashimoto
,
T.
Takuwa
,
N.
Kondo
, and
S.
Hasegawa
,
Ann. Thorac. Surg.
87
,
1669
(
2009
).
182.
M.
Ignatiadis
,
F.
Rothé
,
C.
Chaboteaux
,
V.
Durbecq
,
G.
Rouas
,
C.
Criscitiello
,
J.
Metallo
,
N.
Kheddoumi
,
S. K.
Singhal
,
S.
Michiels
,
I.
Veys
,
J.
Rossari
,
D.
Larsimont
,
B.
Carly
,
M.
Pestrin
,
S.
Bessi
,
F.
Buxant
,
F.
Liebens
,
M.
Piccart
, and
C.
Sotiriou
,
PLoS One
6
,
e15624
(
2011
).
183.
F. A.
Greco
and
J. D.
Hainsworth
,
Semin. Oncol.
36
,
6
(
2009
).
184.
K.
Curtius
,
N. A.
Wright
, and
T. A.
Graham
,
Nat. Rev. Cancer
18
,
19
(
2017
).
185.
I.
Sanchez-Garcia
,
N. Engl. J. Med.
360
,
297
(
2009
).
186.
C. P.
Pipinikas
,
T. S.
Kiropoulos
,
V. H.
Teixeira
,
J. M.
Brown
,
A.
Varanou
,
M.
Falzon
,
A.
Capitanio
,
S. E.
Bottoms
,
B.
Carrol
,
N.
Navani
,
F.
McCaughan
,
J. P.
George
,
A.
Giangreco
,
N. A.
Wright
,
S. A. C.
McDonald
,
T. A.
Graham
, and
S. M.
Janes
,
Thorax
69
,
548
(
2014
).
187.
W. A.
Franklin
,
A. F.
Gazdar
,
J.
Haney
,
I. I.
Wistuba
,
F. G.
la Rosa
,
T.
Kennedy
,
D. M.
Ritchey
, and
Y. E.
Miller
,
J. Clin. Invest.
100
,
2133
(
1997
).
188.
R. A. A.
van Boerdonk
,
I.
Smesseim
,
D. A. M.
Heideman
,
V. M. H.
Coupe
,
D.
Tio
,
K.
Grunberg
,
E.
Thunnissen
,
P. J. F.
Snijders
,
P. E.
Postmus
,
E. F.
Smit
,
J. M. A.
Daniels
, and
T. G.
Sutedja
,
Am. J. Respir. Crit. Care Med.
192
,
1483
(
2015
).
189.
T.
Ishizumi
,
A.
McWilliams
,
C.
MacAulay
,
A.
Gazdar
, and
S.
Lam
,
Cancer Metastasis Rev.
29
,
5
(
2010
).
190.
J.
Dong
,
D.
Zhu
,
X.
Tang
,
X.
Qiu
,
D.
Lu
,
B.
Li
,
D.
Lin
, and
Q.
Zhou
,
Front. Oncol.
9
,
1139
(
2019
).
191.
E.
Friedman
,
M.
Verderame
,
M.
Lipkin
, and
R.
Pollack
,
Cancer Res.
45
,
3236
(
1985
), https://aacrjournals.org/cancerres/article/45/7/3236/489625/Altered-Actin-Cytoskeletal-Patterns-in-Two.
192.
K.
Curtius
,
N. A.
Wright
, and
T. A.
Graham
,
Cold Spring Harbor Perspect. Med.
7
,
19
(
2017
).
193.
S.
Koscielny
and
M.
Tubiana
,
Nat. Rev. Cancer
10
,
156
(
2010
).
194.
M.
Saitoh
,
J. Biochem.
164
,
257
(
2018
).
195.
M.
Suarez-Carmona
,
J.
Lesage
,
D.
Cataldo
, and
C.
Gilles
,
Mol. Oncol.
11
,
805
(
2017
).
196.
B.
de Craene
and
G.
Berx
,
Nat. Rev. Cancer
13
,
97
(
2013
).
197.
D. R.
Caswell
and
C.
Swanton
,
BMC Med.
15
(
1
),
133
(
2017
).
198.
M. K.
Paul
,
A.
Basu
,
B.
Bisht
,
P.
Pagano
,
Y.
Fontebasso
,
K.
Krysan
,
L.
Tran
,
M.
Alioscha-Perez
,
J.
Minna
,
D.
DiCarlo
,
H.
Sahli
,
S.
Weiss
, and
S. M.
Dubinett
, in
AACR Annual Meeting
(
AACR
,
2019
), p.
1030
.
199.
N. V.
Jordan
,
G. L.
Johnson
, and
A. N.
Abell
,
Cell Cycle
10
,
2865
(
2011
).
200.
I.
Pastushenko
,
A.
Brisebarre
,
A.
Sifrim
,
M.
Fioramonti
,
T.
Revenco
,
S.
Boumahdi
,
A.
van Keymeulen
,
D.
Brown
,
V.
Moers
,
S.
Lemaire
,
S.
de Clercq
,
E.
Minguijón
,
C.
Balsat
,
Y.
Sokolow
,
C.
Dubois
,
F.
de Cock
,
S.
Scozzaro
,
F.
Sopena
,
A.
Lanas
,
N.
D'haene
,
I.
Salmon
,
J. C.
Marine
,
T.
Voet
,
P. A.
Sotiropoulou
, and
C.
Blanpain
,
Nature
556
,
463
(
2018
).
201.
A. W.
Lambert
and
R. A.
Weinberg
,
Nat. Rev. Cancer
21
,
325
(
2021
).
202.
A. M.
Gown
,
A. M.
Vogel
,
D.
Gordon
, and
P. L.
Lu
,
J. Cell Biol.
100
,
807
(
1985
).
203.
B.
Kinner
and
M.
Spector
,
J. Orthop. Res.
20
,
622
(
2002
).
204.
W. C.
Tsai
,
F. T.
Tang
,
M. K.
Wong
, and
J. H. S.
Pang
,
J. Orthop. Res.
21
,
265
(
2003
).
205.
J.
Riedl
,
A. H.
Crevenna
,
K.
Kessenbrock
,
J. H.
Yu
,
D.
Neukirchen
,
M.
Bista
,
F.
Bradke
,
D.
Jenne
,
T. A.
Holak
,
Z.
Werb
,
M.
Sixt
, and
R.
Wedlich-Soldner
,
Nat. Methods
5
,
605
(
2008
).
206.
L.
Pan
,
R.
Yan
,
W.
Li
, and
K.
Xu
,
Cell Rep.
22
,
1151
(
2018
).
207.
J.
Qi
,
Y.
Liu
,
C.
Chu
,
X.
Chen
,
W.
Zhu
,
Y.
Shu
,
S.
He
,
R.
Chai
, and
G.
Zhong
,
Cell Discovery
5
,
12
(
2019
).
208.
H. Y.
Suleiman
,
R.
Roth
,
S.
Jain
,
J. E.
Heuser
,
A. S.
Shaw
, and
J. H.
Miner
,
JCI Insight
2
,
e94137
(
2017
).
209.
Y.
Sun
,
H. W.
Schroeder
,
J. F.
Beausang
,
K.
Homma
,
M.
Ikebe
, and
Y. E.
Goldman
,
Mol. Cell
28
,
954
(
2007
).
210.
J. R.
Kuhn
and
T. D.
Pollard
,
Biophys. J.
88
,
1387
(
2005
).
211.
D.
Pavlov
,
A.
Muhlrad
,
J.
Cooper
,
M.
Wear
, and
E.
Reisler
,
J. Mol. Biol.
365
,
1350
(
2007
).
212.
M. B.
Smith
,
T.
Kiuchi
,
N.
Watanabe
, and
D.
Vavylonis
,
Biophys. J.
104
,
247
(
2013
).
213.
H.
Engelke
,
D.
Heinrich
, and
J. O.
Rädler
,
Phys. Biol.
7
,
046014
(
2010
).
214.
F.
Merino
,
S.
Pospich
,
J.
Funk
,
T.
Wagner
,
F.
Küllmer
,
H. D.
Arndt
,
P.
Bieling
, and
S.
Raunser
,
Nat. Struct. Mol. Biol.
25
,
528
(
2018
).
215.
A. S.
Fanning
,
T. Y.
Ma
, and
J. M.
Anderson
,
FASEB J.
16
,
1695
(
2002
).
216.
S.
Krishnaswamy
,
N.
Zivanovic
,
R.
Sharma
,
D.
Pe'Er
, and
B.
Bodenmiller
, “
Learning time-varying information flow from single-cell epithelial to mesenchymal transition data
,”
PLoS One
13
,
e0203389
(
2018
).
217.
D.
van Dijk
,
R.
Sharma
,
J.
Nainys
,
K.
Yim
,
P.
Kathail
,
A. J.
Carr
,
C.
Burdziak
,
K. R.
Moon
,
C. L.
Chaffer
,
D.
Pattabiraman
,
B.
Bierie
,
L.
Mazutis
,
G.
Wolf
,
S.
Krishnaswamy
, and
D.
Pe'er
,
Cell
174
,
716
(
2018
).
218.
M.
Alioscha-Perez
,
C.
Benadiba
,
K.
Goossens
,
S.
Kasas
,
G.
Dietler
,
R.
Willaert
, and
H.
Sahli
,
PLoS Comput. Biol.
12
,
e1005063
(
2016
).
219.
L.
Hauke
,
S.
Narasimhan
,
A.
Primeßnig
, and
I.
Kaverina
,
PLoS One
16
,
e0250749
(
2021
).
220.
C. V.
Rimoli
,
C.
Augusto
,
V.
Cruz
,
V.
Curcio
, and
M.
Mavrakis
,
Nat. Commun.
13
,
301
(
2022
).
221.
W.
Ma
,
H.
Gong
,
V.
Jani
,
M.
Landim-Vieira
,
M.
Papadaki
,
J. R.
Pinto
,
M. I.
Aslam
,
A.
Cammarato
, and
T.
Irving
,
Biophys. J.
121
,
565
(
2022
).
222.
W. M.
Jackson
,
M. J.
Jaasma
,
R. Y.
Tang
, and
T. M.
Keaveny
,
Am. J. Physiol. Cell Physiol.
295
,
1007
(
2008
).
223.
J. D.
Gardinier
,
S.
Majumdar
,
R. L.
Duncan
, and
L.
Wang
,
Cell Mol. Bioeng.
2
,
133
(
2009
).
224.
K.
Son
,
M.
Small
,
R.
Sehmi
, and
L.
Janssen
,
J. Leukocyte Biol.
108
,
129
(
2020
).
225.
L.
Loufrani
and
D.
Henrion
,
Med. Biol. Eng. Comput.
46
,
451
(
2008
).
226.
E. A.
Osborn
,
A.
Rabodzey
,
C. F.
Dewey
, Jr.
, and
J. H.
Hartwig
,
Am. J. Physiol. Cell Physiol.
290
,
C444
(
2006
).
227.
N.
Nabavi
,
A.
Khandani
,
A.
Camirand
, and
R. E.
Harrison
,
Bone
49
,
965
(
2011
).
228.
Z.
Dai
,
F.
Wu
,
J.
Chen
,
H.
Xu
,
H.
Wang
,
F.
Guo
,
T.
Yingjun
,
B.
Ding
,
J.
Wang
,
Y.
Wan
, and
Y.
Li
,
PLoS One
8
,
e63661
(
2013
).
229.
M. Z.
Nassef
,
S.
Kopp
,
M.
Wehland
,
D.
Melnik
,
J.
Sahana
,
M.
Krüger
,
T. J.
Corydon
,
H.
Oltmann
,
B.
Schmitz
,
A.
Schütte
,
T. J.
Bauer
,
M.
Infanger
, and
D.
Grimm
,
Int. J. Mol. Sci.
20
, 3
156
(
2019
).
230.
M.
Janmaleki
,
M.
Pachenari
,
S. M.
Seyedpour
,
R.
Shahghadami
, and
A.
Sanati-Nezhad
,
Sci. Rep.
6
(
1
),
32418
(
2016
).
231.
S. J.
Crawford-Young
,
Int. J. Dev. Biol.
50
,
183
(
2006
).
232.
R.
Kaunas
,
S.
Usami
, and
S.
Chien
,
Cell Signal
18
,
1924
(
2006
).
233.
L.
Zhao
,
C.
Sang
,
C.
Yang
, and
F.
Zhuang
,
J. Biomech.
44
,
2388
(
2011
).
234.
C.
Gögele
,
C.
Hoffmann
,
J.
Konrad
,
R.
Merkel
,
S.
Schwarz
,
M.
Tohidnezhad
,
B.
Hoffmann
, and
G. G.
Schulze-Tanzil
,
Cell Tissue Res.
384
,
789
(
2021
).
235.
H. Y.
Suleiman
,
R.
Roth
,
S.
Jain
,
J. E.
Heuser
,
A. S.
Shaw
, and
J. H.
Miner
,
J. Clin. Invest.
2
,
e94137
(
2017
).
236.
A. C. N.
Brown
,
S.
Oddos
,
I. M.
Dobbie
,
J. M.
Alakoskela
,
R. M.
Parton
,
P.
Eissmann
,
M. A. A.
Neil
,
C.
Dunsby
,
P. M. W.
French
,
I.
Davis
, and
D. M.
Davis
,
PLoS Biol.
9
,
e1001152
(
2011
).
237.
A.
Elosegui-Artola
,
A.
Jorge-Penas
,
O.
Moreno-Arortzena
,
A.
Oregi
,
M.
Lasa
,
J. M.
Garcia-Anzar
,
E. M.
de Juan-Pardo
, and
R.
Aldabe
,
PLoS One
9
,
e107393
(
2014
).
238.
B.
Eltzner
,
C.
Wollnik
,
C.
Gottschlich
,
S.
Huckemann
, and
F.
Rehfeldt
,
PLoS One
10
,
e126346
(
2015
).
239.
R.
Grompone von Gioi
,
J.
Jakubowicz
,
J.-M.
Morel
, and
G.
Randall
,
Image Process. Line
2
,
35
(
2012
).
240.
J. P.
Marquez
,
Int. J. Solids Struct.
43
,
6413
(
2006
).
241.
S.
Malvar
and
B. S.
Carmo
,
J. Braz. Soc. Mech. Sci. Eng.
43
,
207
(
2021
).
242.
A.
Clarke
,
P. G.
McQueen
,
H. Y.
Fang
,
R.
Kannan
,
V.
Wang
,
E.
McCreedy
,
S.
Wincovitch
, and
E.
Giniger
,
Mol. Biol. Cell
31
,
466
(
2020
).
243.
J.
Sampo
,
J.
Takalo
,
S.
Siltanen
,
A.
Miettinen
,
M.
Lassas
, and
J.
Timonen
,
Opt. Eng.
53
,
033109
(
2014
).
244.
E.
Candès
,
L.
Demanet
,
D.
Donoho
, and
L.
Ying
,
Multiscale Modeling Simul.
5
,
861
(
2006
).
245.
M.
Sayadi
,
H.
Ghassemian
,
R.
Naimi
, and
M.
Imani
, in
Iranian Conference on Machine Vision and Image Processing, MVIP
,
2020
.
246.
M.
Arunachalam
and
S. R.
Savarimuthu
,
Int. J. Imaging Syst. Technol.
27
,
216
(
2017
).
247.
Y.
Huang
,
X.
Hu
,
L.
Hao
,
Y.
Gao
,
Z.
Liu
, and
P.
Wang
,
IET Image Process
14
,
2826
(
2020
).
248.
G.
Herberich
,
T.
Würflinger
,
A.
Sechi
,
R.
Windoffer
,
R.
Leube
, and
T.
Aach
, in
Conference Record of the Forty Fourth Asilomar Conference on Signals, Systems and Computers
(
IEEE
,
2010
), p.
1359
.
249.
A.
Rigort
,
D.
Günther
,
R.
Hegerl
,
D.
Baum
,
B.
Weber
,
S.
Prohaska
,
O.
Medalia
,
W.
Baumeister
, and
H. C.
Hege
,
J. Struct. Biol.
177
,
135
(
2012
).
250.
M.
Moch
,
G.
Herberich
,
T.
Aach
,
R. E.
Leube
, and
R.
Windoffer
,
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A.
110
,
10664
(
2013
).
251.
W. T.
Freeman
and
E. H.
Adelson
,
IEEE Trans. Pattern Anal. Mach. Intell.
13
,
891
(
1991
).
252.
L. J.
van Vliet
,
I. T.
Young
, and
G. L.
Beckers
,
Comput. Vision Graphics Image Process
45
,
167
(
1989
).
253.
C.
Winkler
,
M.
Vinzenz
,
J. V.
Small
, and
C.
Schmeiser
,
J. Struct. Biol.
178
,
19
(
2012
).
254.
N.
Otsu
,
IEEE Trans. Syst.
Man Cybern.
20
,
62
(
1979
).
255.
A.
Zemel
,
F.
Rehfeldt
,
A. E. X.
Brown
,
D. E.
Discher
, and
S. A.
Safran
,
Nat. Phys.
6
,
468
(
2010
).
256.
S. K.
Gupta
,
Y.
Li
, and
M.
Guo
,
Soft Matter
15
,
190
(
2019
).
257.
P.
Davidson
,
M.
Bigerelle
,
B.
Bounichane
,
M.
Giazzon
, and
K.
Anselme
,
Acta Biomater.
6
,
2590
(
2010
).
258.
W. J.
Karlon
,
P. P.
Hsu
,
L. I.
Song
,
S.
Chien
,
A. D.
McCulloch
, and
J. H.
Omens
,
Ann. Biomed. Eng.
27
,
712
(
1999
).
259.
W.-T.
Su
,
Y.-F.
Liao
, and
I.-M.
Chu
,
Micron
38
,
278
(
2007
).
260.
Y.
Wang
,
S.
Son
,
S. M.
Swartz
, and
N. C.
Goulbourne
,
Int. J. Solids Struct.
49
,
2914
(
2012
).
261.
A.
Grosberg
,
P. L.
Kuo
,
C. L.
Guo
,
N. A.
Geisse
,
M. A.
Bray
,
W. J.
Adams
,
S. P.
Sheehy
, and
K. K.
Parker
,
PLoS Comput. Biol.
7
,
e1001088
(
2011
).
262.
D.
Volfson
,
S.
Cookson
,
J.
Hasty
, and
L. S.
Tsimring
,
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A.
105
,
15346
(
2008
).
263.
J. G.
Sun
,
J.
Tang
, and
J. D.
Ding
,
Chin. Sci. Bull.
54
,
3154
(
2009
).
264.
A.
Grosberg
,
P. W.
Alford
,
M. L.
McCain
, and
K. K.
Parker
,
Lab Chip
11
,
4165
(
2011
).
265.
A.
Basu
, “
Statistical parametrization of the cell cytoskeleton (SPOCC): A non-invasive image quantification tool to identify and track sub-cellular processes
,” Ph.D. dissertation (
University of California
, Los Angeles,
2021
).
266.
J. L.
Starck
,
M.
Elad
, and
D. L.
Donoho
,
IEEE Trans. Image Process.
14
,
1570
(
2005
).
267.
J. M.
Fadili
,
J.-L.
Starck
,
M.
Elad
, and
D. L.
Donoho
,
Comput Sci Eng
12
,
44
(
2010
).
268.
U. T. V.
Nguyen
,
A.
Bhuiyan
,
L. A. F.
Park
, and
K.
Ramamohanarao
,
Pattern Recognit
46
,
703
(
2013
).
269.
P. D.
Wellner
, Xerox, EPC1993-110 1 (
1993
).
270.
S.
Marcotti
,
D.
Belo de Freitas
,
L. D.
Troughton
,
F. N.
Kenny
,
T. J.
Shaw
,
B. M.
Stramer
, and
P. W.
Oakes
,
Front Comput Sci
3
,
1
(
2021
).
271.
J. M.
Levsky
and
R. H.
Singer
,
J Cell Sci
116
,
2833
(
2003
).
272.
A.-E.
Saliba
,
A. J.
Westermann
,
S. A.
Gorski
, and
J.
Vogel
,
Nucl. Acids Res
42
,
8845
(
2014
).
You do not currently have access to this content.