Rapid detection of brain natriuretic peptide (BNP) concentration can be used for the diagnosis of acute heart failure and for the evaluation of the effectiveness of a clinical therapy. We used the systematic evolution of ligands by exponential enrichment method to develop DNA aptamers for BNP whose sequences were determined by cloning method and consensus sequence analysis. A total of eight conserved sequences was identified. By combining the fluorescent-labeled aptamers with fast protein lab-on-chip analysis, we could achieve quantification of BNP concentrations with high speed, sensitivity, and specificity.

1.
C.
Tuerk
and
L.
Gold
,
Science
249
,
505
(
1990
).
2.
S. M.
Stavis
,
S. C.
Corgié
,
B. R.
Cipriany
,
H. G.
Craighead
, and
L. P.
Walker
,
Biomicrofluidics
1
,
034105
(
2007
).
3.
H.
Esfandyarpour
,
B.
Zheng
,
R. F. W.
Pease
, and
R. W.
Davis
,
Biomicrofluidics
2
,
024102
(
2008
).
4.
S.
Senapati
,
A. R.
Mahon
,
J.
Gordon
,
C.
Nowak
,
S.
Sengupta
,
T. H. Q.
Powell
,
J.
Feder
,
D. M.
Lodge
, and
H. C.
Chang
,
Biomicrofluidics
3
,
022407
(
2009
).
5.
S. E.
Osborne
and
A. D.
Ellington
,
Chem. Rev. (Washington, D.C.)
97
,
349
(
1997
).
6.
M.
Rimmele
,
ChemBioChem
4
,
963
(
2003
).
7.
E. N.
Brody
,
M. C.
Willis
,
J. D.
Smith
,
S.
Jayasena
,
D.
Zichi
, and
L.
Gold
,
Mol. Diagn.
4
,
381
(
1999
).
8.
J.
Ciesiolka
,
J.
Gorski
, and
M.
Yarus
,
RNA
1
,
538
(
1995
).
9.
J. R.
Lorsch
and
J. W.
Szostak
,
Biochemistry
33
,
973
(
1994
).
10.
D. S.
Wilson
and
J. W.
Szostak
,
Annu. Rev. Biochem.
68
,
611
(
1999
).
11.
L. C.
Bock
,
L. C.
Griffin
,
J. A.
Latham
,
E. H.
Vermaas
, and
J. J.
Toole
,
Nature (London)
355
,
564
(
1992
).
12.
S.
Weiss
,
D.
Proske
,
M.
Neumann
,
M. H.
Groschup
,
H. A.
Kretzschmar
,
M.
Famulok
, and
E. L.
Winnacker
,
J. Virol.
71
,
7890
(
1997
).
13.
J. M.
Bacher
and
A. D.
Ellington
,
Drug Discovery Today
3
,
265
(
1998
).
14.
M.
Famulok
,
Curr. Opin. Mol. Ther.
7
,
137
(
2005
).
15.
E. T.
Cunningham
, Jr.
,
A. P.
Adamis
,
M.
Altaweel
,
L. P.
Aiello
,
N. M.
Bressler
,
D. J.
D’Amico
,
M.
Goldbaum
,
D. R.
Guyer
,
B.
Katz
,
M.
Patel
, and
S. D.
Schwartz
,
Ophthalmology
112
,
1747
(
2005
).
16.
M. A.
Siddiqui
and
G. M.
Keating
,
Drugs
65
,
1571
(
2005
).
17.
M.
Menger
,
J.
Glokler
, and
M.
Rimmele
, in
RNA Towards Medicine
, edited by
V. A.
Erdmann
,
J.
Brosius
, and
J.
Barciszewski
(
Springer
,
Berlin
,
2006
), p.
359
.
18.
R.
Nutiu
and
Y.
Li
,
Methods
37
,
16
(
2005
).
19.
K.
Maeda
,
T.
Tsutamota
,
A.
Wada
,
T.
Hisanaga
, and
M.
Kinoshita
,
Am. Heart J.
135
,
825
(
1998
).
20.
S.
Nakamura
,
M.
Naruse
,
K.
Naruse
,
M.
Kawana
,
T.
Nishikawa
, and
S.
Hosoda
,
Am. J. Hypertens.
4
,
909
(
1991
).
21.
G.
Tonolo
,
A. M.
Richards
,
P.
Manunta
,
C.
Troffa
,
A.
Pazzola
, and
P.
Madeddu
,
Circulation
80
,
893
(
1989
).
22.
J. B.
Patel
,
M. L.
Valencik
,
A. M.
Pritchett
,
J. C.
Jr Burnett
,
J. A.
McDonald
, and
M. M.
Redfield
,
Am. J. Physiol. Heart Circ. Physiol.
289
,
H777
(
2005
).
23.
N.
Tamura
,
Y.
Ogawa
,
A.
Yasoda
,
H.
Itoh
,
Y.
Saito
, and
K.
Nakao
,
J. Mol. Cell. Cardiol.
28
,
1811
(
1996
).
24.
A. M. E.
Koch
,
S.
Zink
,
H.
Singer
, and
S.
Dittrich
,
Eur. J. Heart Fail.
10
,
60
(
2008
).
25.
T. W.
Vogelsang
,
R. J.
Jensen
,
A. L.
Monrad
,
K.
Russ
,
U. H.
Olesen
,
B.
Hesse
, and
A.
Kjær
,
Eur. J. Heart Fail.
9
,
892
(
2007
).
26.
J. G.
Crilley
and
M.
Farrer
,
Heart
86
,
638
(
2001
).
27.
A. L.
Ferreira
,
Z. S.
Reis
,
J.
Braga
,
H. V.
Leite
, and
A. C.
Cabral
,
Arch. Gynecol. Obstet.
279
,
335
(
2009
).
28.
J.
Hogenhuis
,
A. A.
Voors
,
T.
Jaarsma
,
H. L.
Hillege
,
F.
Boomsma
, and
D. J.
van Veldhuisen
,
Eur. J. Heart Fail.
7
,
81
(
2005
).
29.
J. F.
Hsieh
and
S. T.
Chen
,
Biomicrofluidics
1
,
014102
(
2007
).
30.
N.
Saitoi
and
M.
Nei
,
Mol. Biol. Evol.
4
,
406
(
1987
).
31.
A. D.
Ellington
and
J. W.
Szostak
,
Nature (London)
346
,
818
(
1990
).
32.
S. M.
Shamah
,
J. M.
Healy
, and
S. T.
Cload
,
Acc. Chem. Res.
41
,
130
(
2008
).
33.
B. O.
Noll
,
H.
Debelak
, and
E.
Uhlmann
,
J. Chromatogr., B: Analyt. Technol. Biomed. Life Sci. Appl.
847
,
153
(
2007
).
34.
T.
Cui
and
F.
Leng
,
Biochemistry
46
,
13059
(
2007
).
35.
V.
Lyamichev
,
M. A.
Brow
, and
J. E.
Dahlberg
,
Science
260
,
778
(
1993
).
36.
V.
Dolnik
,
S.
Liu
, and
S.
Jovanovich
,
Electrophoresis
21
,
41
(
2000
).
37.
C. S.
Effenhauser
,
G. J. M.
Bruin
, and
A.
Paulus
,
Electrophoresis
18
,
2203
(
1997
).
38.
J.
Nawarak
,
S.
Sinchaikul
,
C. Y.
Wu
,
M. Y.
Liau
,
S.
Phutrakul
, and
S. T.
Chen
,
Electrophoresis
24
,
2838
(
2003
).
You do not currently have access to this content.