The COVID-19 outbreak is caused by the Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2). Various in-silico studies have been conducted to find alternative drugs against this virus, ginger. The compounds contained in ginger have been shown to have pharmacological properties as antioxidant, anti-inflammatory, antimicrobial, anticancer, neuroprotective, cardiovascular protective, respiratory protective, and antidiabetic activities. This study aims to determine the potent compounds contained in ginger to fight SARS-CoV-2 through inhibition of Membrane (M), Envelope (E), Nucleocapsid (N), Plpro, and Helicase Proteins. The results demonstrated that curcumin, quercetin, genistein, β-sitosterol, bisdemethoxycurcumin, γ-cadinene, [7]-gingerol, (S)-6-gingerol and [10]-gingerdiol had the potential to inhibit target proteins with better binding free energy values with one or several proteins than Favipiravir and Remdesivir.
REFERENCES
1.
M.
Bianchi
, D.
Benvenuto
, M.
Giovanetti
, S.
Angeletti
, M.
Ciccozzi
, and S.
Pascarella
, BioMed Res. Int.
4389089
(2020
).2.
R.
Lu
, X.
Zhao
, J.
Li
, P.
Niu
, B.
Yang
, H.
Wu
, W.
Wang
, H.
Song
, B.
Huang
, N.
Zhu
, et al, Lancet
565-574
, 395
(2020
).3.
4.
5.
E.
Janik
, M.
Niemcewicz
, M.
Podogrocki
, J.
Saluk-Bijak
, and M.
Bijak
, Int. J. Mol. Sci.
22
, 5434
(2021
).6.
U.
Agrawal
, R.
Raju
, and Z. F.
Udwadia
, Med. J. Armed Forces India
76
, 4
(2020
).7.
J.H.
Beigel
, K.M.
Tomashek
, L. E.
Dodd
, A. K.
Mehta
, B. S.
Zingman
, A. C.
Kalil
, E.
Hohmann
, H. Y.
Chu
, A.
Luetkemeyer
, S.
Kline
, et al, N. Engl. J. Med.
383
, 19
(2020
).8.
W-C.
Ko
, J-M.
Rolain
, N-Y.
Lee
, P-L.
Chen
, C-T.
Huang
, P-I.
Lee
, and P-R.
Hsueh
, Int. J. Antimicrob. Agents.
55
, 105933
(2020
).9.
10.
J.
Yang
, S. J. L.
Petitjean
, M.
Koehler
, Q.
Zhang
, A.C.
Dumitru
, W.
Chen
, S.
Derclaye
, S. P.
Vincent
, P.
Soumillion
, and D.
Alsteens
, Nat. Commun.
11
, 4541
(2020
).11.
Z.
Jin
, X.
Du
, Y.
Xu
, Y.
Deng
, M.
Liu
, Y.
Zhao
, B.
Zhang
, X.
Li
, L.
Zhang
, C.
Peng
, et al, Nature
289-293
, 582
(2020
).12.
A. M.
Sardanelli
, C.
Isgrò
, and L. L.
Palese
, Molecules
26
, 1409
(2021
).13.
D. M.
Teli
, M. B.
Shah
, and M. T.
Chhabria
, Front. Mol. Biosci.
7
, 599079
(2021
).14.
15.
Y.
Peng
, N.
Du
, Y.
Lei
, S.
Dorje
, J.
Qi
, T.
Luo
, G. F.
Gao
, and H.
Song
, EMBO J.
39
20
e105938
(2020
).16.
M. K.
Gupta
, S.
Vemula
, R.
Donde
, G.
Gouda
, L.
Behera
, and R.
Vadde
, J. Biomol. Struct. Dyn.
2617-2627
, 39
(2021
).17.
18.
19.
K.
Rajagopal
, G.
Byran
, S.
Jupudi
, and R.
Vadivelan
, Int. J. Health Allied Sci.
S43–50
, 9
(2020
).20.
21.
M.
Haridas
, V.
Sasidhar
, P.
Nath
, J.
Abhithaj
, A.
Sabu
, and P.
Rammanohar
, Futur. J. Pharm. Sci.
7
, 13
(2021
).22.
Q-Q.
Mao
, X-Y.
Xu
, S-Y.
Cao
, R-Y.
Gan
, H.
Corke
, T.
Beta
, and H-B.
Li
, Foods
8
, 185
(2019
).23.
A. H.
Ahkam
, F. E.
Hermanto
, A.
Alamsyah
, I. H.
Aliyyah
, and F.
Fatchiyah
, J. Bio. Res.
52-57
, 25
(2020
).24.
A.
Joshi
, G. S.
Krishnan
, and V.
Kaushik
, J. Genet. Eng. Biotechnol.
18
, 78
(2020
).25.
T.
Rathinavel
, M.
Palanisamy
, S.
Palanisamy
, A.
Subramanian
, and S.
Thangaswamy
, Int. J. Adv. Sci. Eng.
1482-1489
, 6
(2020
).26.
P.
Calligari
, S.
Bobone
, G.
Ricci
, and A.
Bocedi
, Viruses
12
, 445
(2020
).27.
X.
Hu
, Z.
Zhou
, F.
Li
, Y.
Xiao
, Z.
Wang
, J.
Xu
, F.
Dong
, H.
Zheng
, and R.
Yu
, Heliyon
7
, e06387
(2021
).28.
S.
Kim
, J.
Chen
, T.
Cheng
, A.
Gindulyte
, J.
He
, S.
He
, Q.
Li
, B. A.
Shoemaker
, P. A.
Thiessen
, B.
Yu
, L.
Zaslavsky
, J.
Zhang
, and E. E.
Bolton
, Nucleic Acids Res.
D1102–09
, 47
(2019
).29.
S.
Wan
, A. P.
Bhati
, S. J.
Zasada
, and P. V.
Coveney
, Interface Focus.
10
, 20200007
(2020
).30.
X.
Du
, Y.
Li
, Y-L
Xia
, S-M.
Ai
, J.
Liang
, P.
Sang
, X-L.
Ji
, and S-Q.
Liu
, Int. J. Mol. Sci.
17
, 144
(2016
).31.
A.
Almaraj
, A.
Pius
, S.
Gopi
, and S.
Gopi
, J. Tradit. Complement. Med.
205-233
, 7
(2016
).32.
S. J.
Hewlings
and D. S.
Kalman
, Foods
6
, 92
(2017
).33.
B.A. C.
Rattis
, S. G.
Ramos
, and M. R. N.
Celes
, Front. Pharmacol.
12
, 675287
(2021
).34.
C.
Guijarro-Real
, M.
Plazas
, A.
Rodríguez-Burrezo
, J.
Prohens
and A.
Fita
, Foods
10
, 1503
(2021
).35.
A. B.
Jena
, N.
Kanungo
, V.
Nayak
, G. B. N.
Chainy
, and J.
Dandapat
, Sci. Rep.
11
, 8482
(2021
).36.
H. S.
Tuli
, M. J.
Tuorkey
, F.
Thakral
, K.
Sak
, M.
Kumar
, A. K.
Sharma
, U.
Sharma
, A.
Jain
, V.
Aggarwal
, and A.
Bishayee
, Front. Pharmacol.
10
, 1336
(2019
).37.
P.
Thangavel
, A.
Puga-Olguín
, J. F.
Rodríguez-Landa
, and R. C.
Zepeda
, Molecules
24
, 3892
(2019
).38.
S.
Babu
, and S.
Jayaraman
, Biomed. Pharmacother.
131
, 110702
(2020
).39.
40.
41.
S. K.
Sandur
, M. K.
Pandey
, B.
Sung
, K. S.
Ahn
, A.
Murakami
, G.
Sethi
, P.
Limtrakul
, V.
Badmaev
, B. B.
Anggarwal
, Carcinogenesis.
1765-1773
, 28
(2007
).42.
F.
Achimón
, V. D.
Brito
, R. P.
Pozzolitto
, A. R.
Sanchez
, E. A.
Gómez
, and J. A.
Zygaldo
, Rev. Argent. Microbiol.
S0325-7541
, 21
(2020
).43.
I. C.
Marinas
, E.
Oprea
, M.
Buleandra
, I. A.
Badea
, B. M.
Tihauan
, L.
Marutescu
, M.
Angheloiu
, E.
Matei
, and M. C.
Chifiriuc
, Molecules
26
, 3146
(2021
).44.
C. d-J. P.
Franco
, O. O.
Ferreira
, Â. A. Barbosa
de Moraes
, E. L. P.
Varela
, L. D. d.
Nascimento
, S.
Percário
, M. S.
de Oliveira
, and E. H. d-A. Andrade, Molecules
26
, 3292
(2021
).45.
L. T.
Huong
, N. T.
Viet
, L. N.
Sam
, C. N.
Giang
, N. H.
Hung
, D. N.
Dai
, and I. A.
Ogunwande
, Bol. Latinoam Caribe. Plant Med. Aromat.
81-89
, 20
(2021
).46.
S.
Muthumanickam
, A.
Kamaladevi
, P.
Boomi
, S.
Gowrishankar
, and S. K.
Pandian
, Front. Mol. Biosci.
8
, 637329
(2021
).47.
A.
Arya
, R.
Chahal
, R.
Rao
, M. H.
Rahman
, D.
Kaushik
, M. F.
Akhtar
, A.
Saleem
, S. M. A.
Khalifa
, H. R.
El-Seedi
, M.
Kamel
, et al, Biomolecules.
11
, 350
(2021
).48.
H.
Chen
, D. N.
Soroka
, J.
Haider
, K. F.
Ferri-Lagneau
, T-C.
Leung
, and S.
Sang
, J. Agric. Food Chem.
61
, 22
(2013
).49.
Y.
Nishidono
, A.
Saifudin
, M.
Nishizawa
, T.
Fujita
, M.
Nakamoto
, and K.
Tanaka
, Nat. Prod. Commun.
869-873
, 13
(2018
).50.
51.
M.
Kumara
, M. R.
Shylajab
, P. A.
Nazeemc
, and T.
Babu
, J. Dev. Drugs.
6
, 1000167
(2017
).52.
R. F.
Hayati
, C. D.
Better
, D.
Denis
, A. G.
Komarudin
, A.
Bowolaksono
, B.
Yohan
, and R. T.
Sasmono
, Biomed Res. Int.
ID6623400
, (2021
).53.
S. A.
Almatroodi
, A. M.
Alnuqaydan
, A. Y.
Babiker
, M. A.
Almogbel
, A. A.
Khan
, and A. H.
Rahmani
, Pharmaceutics
13
, 317
(2021
).54.
S. D.
Jolad
, R. C.
Lantz
, A. M.
Solyom
, G. J.
Chen
, R. B.
Bates
, and B. N.
Timmermann
, Phytochemistry
1937-1954
, 65
(2004
).55.
B. W.
Neuman
, G.
Kiss
, A. H.
Kunding
, D.
Bhella
, M. F.
Baksh
, S.
Connelly
, B.
Droese
, J. P.
Klaus
, S.
Makino
, S. G.
Sawicki
, et al, J. Struct. Biol.
11-22
, 174
(2011
).56.
D.
Schoeman
, and B. C.
Fielding
, Virol. J.
16
, 69
(2019
).57.
N. A.
Wong
, and M. H. Jr.
Saier
, Int. J. Mol. Sci.
22
, 1308
(2021
).58.
D.
Dey
, S.
Borkotoky
, and M.
Banerjee
, Comput. Biol. Med.
127
, 104063
(2020
).59.
Z.
Bai
, Y.
Cao
, W.
Liu
, and J.
Li
, Viruses
13
, 1115
(2021
).60.
A.
Kwarteng
, E.
Asiedu
, S. A.
Sakyi
, and S. O.
Asiedu
, Biomed. Pharmacother.
132
, 110914
(2020
).61.
M.
Zhao
, Y.
Yu
, L. M.
Sun
, J. Q.
Xing
, T.
Li
, Y.
Zhu
, M.
Wang
, Y.
Yu
, W.
Xue
, T.
Xia
, et al, Nat. Commun.
12
, 2114
(2021
).62.
Y. M.
Báez-Santos
, and S. E. St.
John
, A. D.
Mesecar
, Antiviral Res.
21-38
, 115
(2015
).63.
C.
Wu
, Y.
Liu
, Y.
Yang
, P.
Zhang
, W.
Zhong
, Y.
Wang
, Q.
Wang
, Y.
Xu
, M.
Li
, X.
Li
, M.
Zheng
, L.
Chen
, and H.
Li
, Acta Pharm. Sin. B.
766-788
, 10
(2020
).64.
65.
S.
Habtemariam
, S. F.
Nabavi
, M.
Banach
, I.
Berindan-Neagoe
, K.
Sarkar
, P. C.
Sil
, and S. M.
Nabavi
, Arch. Med. Res.
733-735
, 51
(2020
).66.
A. N.
Spratt
, F.
Gallazzi
, T. P.
Quinn
, C. L.
Lorson
, A.
Sönnerborg
, and K.
Singh
, Expert Opin. Ther. Pat.
339–350
, 31
(2021
).
This content is only available via PDF.
©2023 Authors. Published by AIP Publishing.
2023
Author(s)
You do not currently have access to this content.
